Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P06323 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P06323 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P06323 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P06323 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P06323 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P06323 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P06323 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P06323 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms