Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01636 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01636 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01636 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01636 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01636 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms