Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CopeO89079 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CopeO89079 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CopeO89079 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CopeO89079 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms