Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ShdO88834 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ShdO88834 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ShdO88834 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ShdO88834 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ShdO88834 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms