Protein–RNA interactions for Protein: O88199

Chst3, Carbohydrate sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst3O88199 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chst3O88199 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chst3O88199 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chst3O88199 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms