Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms