Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lgals6O54891 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms