Protein–RNA interactions for Protein: O54863

Tssk2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk2O54863 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tssk2O54863 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tssk2O54863 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tssk2O54863 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tssk2O54863 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tssk2O54863 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tssk2O54863 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms