Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DffaO54786 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DffaO54786 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DffaO54786 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DffaO54786 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DffaO54786 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DffaO54786 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms