Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctnnd2O35927 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms