Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnc1O35914 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms