Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn1mwO35599 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn1mwO35599 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms