Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kpna4O35343 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms