Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sh2d1bO35324 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d1bO35324 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d1bO35324 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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