Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ArxO35085 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ArxO35085 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms