Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HgdO09173 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HgdO09173 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HgdO09173 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HgdO09173 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HgdO09173 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HgdO09173 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HgdO09173 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HgdO09173 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HgdO09173 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms