Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Casq1O09165 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Casq1O09165 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casq1O09165 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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