Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec22bO08547 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sec22bO08547 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec22bO08547 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms