Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
U90926O08546 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
U90926O08546 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
U90926O08546 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms