Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efna5O08543 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms