Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MsmbO08540 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
MsmbO08540 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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