Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm379J3QQ19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms