Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms