Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer2J3QPU5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms