Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm2035J3QP87 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm2035J3QP87 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms