Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21897J3KMP5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms