Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms