Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r39G3UWE6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms