Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp988F6VKC7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zfp988F6VKC7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp988F6VKC7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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