Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20671F6TVX7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20671F6TVX7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms