Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Raph1F2Z3U3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Raph1F2Z3U3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms