Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms