Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nolc1E9Q5C9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nolc1E9Q5C9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms