Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
DspE9Q557 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
DspE9Q557 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms