Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r56E9Q4U5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms