Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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