Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm9972E9Q053 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm9972E9Q053 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm9972E9Q053 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms