Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc8E9PWG2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms