Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd5D6MZJ6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms