Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms