Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd1D3YXK1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms