Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp26c1B2RXA7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms