Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms