Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms