Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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