Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samt1A2BED8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms