Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl41A2AUC9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms