Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttll9A2APC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms