Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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