Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calcoco2A2A6M5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms